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1993년 국제연합환경계획(UNEP)에서 발표한 ‘생물다양성 국가 연구에 관한 지침서’에서 생물 다양성을 지키는 방안으로 처음 제시되었습니다. 깃대종은 특정지역의 생태환경의 상태를 가늠할 수 있는 지표가 되기에 환경보전의 정도를 나타내거나, 복원의 증거가 되는 특정 지역의 생태계를 대표하는 종입니다. 대부분 천연기념물, 멸종위기종, 희귀종, 고유종 등 법으로 보호를 받는 야생동식물을 선정하고 있습니다.